Handelns storhetstid var förbi för Visby. Då baltikum blev kristnat och kusten fri, gick skeppen allt mer direkt till sina destinationer.

På 1600-talet planerade man att riva stadsmuren och ersätta den med moderna bastioner. Stadsplanen skulle ersättas med en rutnätsplan. Bristande ekonomi förhindrade detta. Resurser till förstärkningar kom emellertid i början av 1700-talet.

Gotland blev åter svenskt år 1645 när ett fredsavtal skrevs i Brömsebro. Nu var det jordbruket som var den viktigaste näringen på Gotland.